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Ja, du kannst bei Projekteinstellungen im VS Startparameter angeben (im Debug-Tab oder so). Die übergebenen Parameter kannst du in CDeineApp::InitInstance() auslesen. Das müsste mit ParseCommandLine() gehen. Sieh mal in die MSDN Lib.
in der Klasse gibt es das member m_lpCmdLine in dem steht der komplette CmdLine String (nicht einzelne Strings)
oder du schaust in der MSDN CWinApp:arseCommandLine