Ich bin mir zwar relativ sicher, dass ich irgendwas falsch verstanden habe, aber du kannst doch Layer ganz einfach umbenennen? Wenn dich die Klickerei nervt, dann kannst du auch die Tabulator-Taste nutzen, um von Ebene zu Ebene zu springen und direkt den Ebenennamen eingeben zu können.
Wenn es noch komfortabler gehen soll, dann musst du dir ein Script schreiben. Vermutlich overkill wenn du das nicht ständig machen musst, sondern eher eine einmalige Aktion für dein Templatefile ist.
Was meinst du mit "Verknüpfungen"? Dieser Begriff sagt mir im Moment erstmal nichts, im Zusammenhang mit Ebenen. *kopfkratz*
Gruß
Martin