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..also ich verstehs auch nicht ganz...
Willst du ein "Programm" im Sinne von Windows-Application, also lokale Installation, oder eine Web-Page bei der man auf einen Button (Durchsuchen) klickt, eine Datei auswählt und dann auf einen weiteren Button "Upload" zum hochladen klickt?
Zweiteres ist extrem einfach, da gibts das ASP-FileUpload-Control, ersteres könntest du z.B. über FTP lösen und macht ein bißchen mehr arbeit (glaube ich)...