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So, an den div's lag es nicht.
Das Problem war, dass ich im CSS, welches die DIV'S definiert hat, border:none gesetzt hatte.
"border:none" heisst für NN4.7 "border:viele-lustige-px-breit-machen".
Diese hatten dieselbe Frabe wie der Hintergrund, und somit sah es so aus, als wäre der Layer einfach versetzt, also falscher Fehler, es lag am ungewollten border.