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Unter Windows ME werden die Startdateien "CONFIG.SYS" und "AUTOEXEC.BAT" (und auch "WINSTART.BAT") nicht mehr ausgeführt - manuelle Änderungen werden nach einem Neustart wieder verworfen. Die beiden Dateien sind nur noch für andere Programme aus Kompatibilitäts-Gründen vorhanden. Dabei geht Windows ME folgendermaßen vor: Ändert man die Dateien "CONFIG.SYS" und "AUTOEXEC.BAT" manuell, so legt Windows ME beim herunterfahren BAK-Kopien von diesen Dateien an und überschreibt die vorhandene "CONFIG.SYS" und "AUTOEXEC.BAT" mit eigenen Default-Werten. Das kann man nachprüfen, wenn man anschließend von einer Diskette bootet und sich die Dateien mit einem Editor anschaut. Wenn man nun auf den Gedanken kommt, man könnte jetzt die Default-Dateien löschen und die BAK-Dateien wieder umbenennen in "CONFIG.SYS" und "AUTOEXEC.BAT", so nützt das gar nichts - beim erneuten booten führt Windows ME diese Dateien nicht aus.