Das einzigste was ich bei diesen ungenauen Angeben mir denken könnte, dass irgendwelche Librarys die das Programm benötigt nicht installiert sind....und da bei Ubuntu schon sehr viel von Haus aus installiert ist, kann es sein, dass du es nachinstallieren musst.
Oder, dass das Programm keine relativen Pfade benutzt und du es von einem anderen Ordner aus startest...vielleicht mal die config prüfen.
Oder es ist installiert, aber er sucht einfach am falschen Ort....im Zweifelsfall einen Softlink erstellen zum Ort (ln -s)
Aber um mehr sagen zu können, muss ich schon mehr wissen.