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Sicherlich könntest Du damit auch andere Wege gehen, aber dafür kenne ich mich mit Tomcat nicht aus.
Ich nutze Common Configuration (=> http://commons.apache.org/configuration/) zum Einlesen von Konfigurationsdateien, weil ich darin mehr Möglichkeiten sehe als mit Properties zum Beispiel.
Ja, die .jar Dateien mußt Du im CLASSPATH mit einbinden.
Die Konfigurationsdatei kannst Du mit einem Texteditor erstellen und wo Du sie ablegst, definierst Du mit:
Java:
private static final String CONF_FILE = "inc/settings";
//edit
Für das Testen der Klasse, mußt Du allerdings nicht zwangsweise mal kurz ne Konfigurationsdatei anlegen. Du kannst die entsprechenden Werte für die Datenbankverbindung auch direkt in den Quelltext schreiben.
