So, hier meine Lösung in C# (ist etwas lang...):

Code csharp:
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using System;
using System.Collections.Generic;
using System.IO;
 
namespace BrainScript
{
    class Program
    {
        static void Main(string[] args)
        {
            SourceCode objSource;
            Interpreter objInterpreter;
 
            //Sourcedatei ermitteln
            if (args.Length > 0)
            {
                objSource = new SourceCode(args[0]);
            }
            else
            {
                Console.Write("Bitte geben Sie eine Quelldatei an: ");
                objSource = new SourceCode(Console.ReadLine());
            }
 
            if (string.IsNullOrEmpty(objSource.Source))
                return;
 
            //Mit der Ausfuehrung beginnen
            objInterpreter = new Interpreter(objSource);
            objInterpreter.StartInterpreting();
 
            //Ausfuehrungbeenden
            Console.WriteLine(Environment.NewLine + Environment.NewLine + "Die Ausführung wurde beendet!");
            Console.ReadLine();
        }
    }
 
    class Interpreter
    {
        private TokenStream objStream;
 
        public Interpreter(SourceCode objCode)
        {
            this.objStream = new TokenStream(objCode);
        }
 
        public void StartInterpreting()
        {
            List<byte> objMemoryCells = new List<byte>();
            int intCellPointer = 0;
            char chrKeyChar;
 
            this.objStream.GenerateStream();
 
            objMemoryCells.Add(0);
 
            for (int i = 0; i < this.objStream.Stream.Count; i++)
            {
                switch (this.objStream.Stream[i].Type)
                {
                    case TokenType.CellIncrement:
                        {
                            objMemoryCells[intCellPointer]++;
                        }
                        break;
                    case TokenType.CellDecrement:
                        {
                            objMemoryCells[intCellPointer]--;
                        }
                        break;
                    case TokenType.PointerIncrement:
                        {
                            intCellPointer++;
 
                            if (intCellPointer >= objMemoryCells.Count)
                                objMemoryCells.Add(0);
                        }
                        break;
                    case TokenType.PointerDecrement:
                        {
                            intCellPointer--;
 
                            if (intCellPointer < 0)
                                intCellPointer = objMemoryCells.Count - 1;
                        }
                        break;
                    case TokenType.Print:
                        Console.Write((char)objMemoryCells[intCellPointer]);
                        break;
                    case TokenType.Read:
                        chrKeyChar = Console.ReadKey().KeyChar;
 
                        if (chrKeyChar != '\r')
                            objMemoryCells[intCellPointer] = (byte)chrKeyChar;
                        else
                            objMemoryCells[intCellPointer] = 0;
                        break;
                    case TokenType.LoopBegin:
                        {
                            if (objMemoryCells[intCellPointer] == 0)
                            {
                                i = this.objStream.Stream.FindIndex(i, delegate(Token objToken) 
                                {
                                    if (objToken.Type == TokenType.LoopEnd)
                                        if (((LoopToken)objToken).Level == ((LoopToken)this.objStream.Stream[i]).Level)
                                            return true;
                                        else
                                            return false;
                                    else
                                        return false;
                                });
                            }
                        }
                        break;
                    case TokenType.LoopEnd:
                        {
                            i = this.objStream.Stream.FindLastIndex(i, i, delegate(Token objToken)
                            {
                                if (objToken.Type == TokenType.LoopBegin)
                                    if (((LoopToken)objToken).Level == ((LoopToken)this.objStream.Stream[i]).Level)
                                        return true;
                                    else
                                        return false;
                                else
                                    return false;
                            }) - 1;
                        }
                        break;
                }
            }
        }
    }
 
    class SourceCode
    {
        private string strSource;
 
        public SourceCode(string strFilePath)
        {
            if (File.Exists(strFilePath))
                strSource = File.ReadAllText(strFilePath);
            else
                Console.WriteLine("Die von Ihnen angegebene Datei konnte nicht gefunden werden.");
        }
 
        public string Source
        {
            get { return this.strSource; }
        }
    }
 
    class TokenStream
    {
        private List<Token> lstTokenStream;
        private SourceCode objCode;
 
        public TokenStream(SourceCode objCode)
        {
            this.lstTokenStream = new List<Token>();
            this.objCode = objCode;
        }
 
        public void GenerateStream()
        {
            int intLoopLevel = 0;
 
            for (int i = 0; i < this.objCode.Source.Length; i++)
            {
                switch (this.objCode.Source[i])
                {
                    case '+':
                        this.lstTokenStream.Add(new GeneralToken(TokenType.CellIncrement));
                        break;
                    case '-':
                        this.lstTokenStream.Add(new GeneralToken(TokenType.CellDecrement));
                        break;
                    case '>':
                        this.lstTokenStream.Add(new GeneralToken(TokenType.PointerIncrement));
                        break;
                    case '<':
                        this.lstTokenStream.Add(new GeneralToken(TokenType.PointerDecrement));
                        break;
                    case '.':
                        this.lstTokenStream.Add(new GeneralToken(TokenType.Print));
                        break;
                    case ',':
                        this.lstTokenStream.Add(new GeneralToken(TokenType.Read));
                        break;
                    case '[':
                        this.lstTokenStream.Add(new LoopToken(TokenType.LoopBegin, intLoopLevel));
                        intLoopLevel++;
                        break;
                    case ']':
                        intLoopLevel--;
                        this.lstTokenStream.Add(new LoopToken(TokenType.LoopEnd, intLoopLevel));
                        break;
                }
            }
        }
 
        public List<Token> Stream
        {
            get { return this.lstTokenStream; }
        }
    }
 
    abstract class Token
    {
        protected TokenType objType;
 
        protected Token(TokenType objType)
        {
            this.objType = objType;
        }
 
        public TokenType Type
        {
            get { return this.objType; }
        }
    }
 
    class GeneralToken : Token
    {
        public GeneralToken(TokenType objType) : base(objType)
        { }
    }
 
    class LoopToken : Token
    {
        private int intLevel;
 
        public LoopToken(TokenType objType, int intLevel)
            : base(objType)
        {
            this.intLevel = intLevel;
        }
 
        public int Level
        {
            get { return this.intLevel; }
        }
    }
 
    enum TokenType : byte
    {
        CellIncrement = 0,
        CellDecrement = 1,
        PointerIncrement = 2,
        PointerDecrement = 3,
        Print = 4,
        Read = 5,
        LoopBegin = 6,
        LoopEnd = 7
    }
}

Das Funktionsprinzip ist folgendermaßen:

Am Anfang wird die Datei in einen Tokenstream umgewandlet, welcher, in Falle von LoopTokens, attributiert wird.

Mit diesem attributierten Stream ist das Interpretieren ein Kinderspiel.

Find das so sauberer als zB einfach nur den Quelltext als String durchzugehen und zu interpretieren.

So, Kritik bitte!